Descriptif du poste : Ingénieur spécialiste « séquençage NGS » H/F
L’Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée Infection est l’un des six IHU en France lauréats du Fond d’Investissement d’avenir. Le projet est porté par la Fondation Méditerranée Infection dont l’objectif est de concentrer les moyens de lutte contre les maladies infectieuses, première cause de mortalité dans le monde. L’IHU Méditerranée Infection a ouvert ses portes en décembre 2016 et est située sur le site du CHU de la Timone à Marseille. Elle accueille des activités de diagnostic, de recherche, d’enseignement et de soins. Forte de ses partenariats avec ses membres fondateurs – l’AP-HM, Aix-Marseille Université, l’INSERM, l’IRD, l’EFS et BioMérieux – L’IHU Méditerranée Infection renforce sa plateforme de séquençage génomique
Poste et missions :
La plateforme de séquençage génomique de l’IHU Méditerranée Infection est équipée d’un séquenceur dernière génération NOVASEQ 6000 (Illumina), de 4 séquenceurs MiSeq (Illumina) et de séquenceurs MinION, GridION et PromethION (Oxford Nanopore). Ces ressources ont été pleinement mobilisées pour le séquençage massif des souches COVID-19. L’IHU fait partie des 4 plateformes nationales de références pour la veille épidémiologique des variants du Sars-COV-2. Plus de 600 séquences complètes de génomes sont réalisées par semaine. Cette période a montré la nécessité d’avoir un référent sur les méthodologies et la standardisation des process de séquençage afin d’améliorer la qualité globale des séquences obtenues et de réduire les temps de séquençage.
Vos principales missions :
- Mise au point et développement de techniques de séquençage
- Standardisation et amélioration des protocoles de préparation des banques de séquençages
- Standardisation et amélioration des protocoles d’extraction des acides nucléiques en vue de séquençage
- Assurer une veille de la littérature et des innovations technologiques en terme de réactifs et d’instruments de séquençage à Haut débit.
Profil :
Titulaire d’une formation BAC+5 en ingénierie biologie moléculaire et/ou génétique
Autonome et organisé(e) dans votre travail, vous êtes reconnu(e) pour votre polyvalence, vos capacités relationnelles et d’adaptation. Vous savez définir des priorités d’action au quotidien, hiérarchiser les urgences et les échéances.
CDI – Rémunération selon profil
Poste basé à Marseille
