Chaque année, le Muséum national d'Histoire naturelle publie la liste des espèces décrites et recensées sur l'ensemble du territoire national au travers du référentiel taxonomique national TAXREF, réalisé par l'unité Patrimoine naturel (Muséum/AFB/CNRS). TAXREF constitue ainsi la base de travail pour les acteurs de la gestion de l'environnement et de la biologie de la conservation ; dans cette 12e version, ce sont 182 854 espèces de faune, de flore, de fonge et de bactéries, terrestres et marines, qui sont inventoriées en France.